AlphaHelix - PCR-teknikens Spotify

2009-08-03 12:44, Edited at: 2011-03-11 05:49

En kortfattad analys av AlphaHelix - ett företag som utvecklar ett revolutionerande verktyg (Quantyper) för analys av DNA. Företaget är i sin linda, men har otroligt stora potentialer både lokalt och globalt. Denna analys framhäver varför deras metod är uppsendeväckande.

IntroduktionBör kanske börja med att förklara att detta är min fösta analys på RedEye, men att jag är väl bevandrad inom den medicinska världen pga. en masterexamen i molekylärbiologi samt att jag doktorerar inom medicin. Denna analys skall vara till vägledning för de som inte riktigt är invigda i biotekninkens värld.

Problematiken idagKvantitativ direktanalyserad PCR (eng. Real time PCR även kallad q-PCR), är en molekylärbiologisk metod som används för att mäta mängden av visst DNA eller RNA i en vävnad eller en grupp av celler. Poängen med metoden är att kunna mäta mängden DNA eller RNA som fanns i lösningen innan reaktionen började och därmed kunna fastställa en mängd DNA/RNA.

En q-PCR idag körs oftast i 40 cyklar (se nedan) där varje cykel tar en viss bestämd tid.

• Initialt denatureringssteg - Provet blandas och upphettas till 95 grader (2-5 min)
• Denatureringsfasen - DNA/RNA kedjan öppnas (1-4 min)
• Primer påkoppling - Motsatta baspar kopplas på DNA/RNA kedjan (1-2 min)
• Utökningssteg - DNA/RNA-kedjans längd utökas och stängs (1 min)
• Upprepas 40 gånger

Efter den sista cyeln utförs ytterligare ett steg som skall sluta alla eventuella kvarvarande öppna DNA/RNA kedjor (15-30 min).

Summasumarum tar en analys runt 2-5 timmar (beroende på upplägget), vilket då medför att 1 till 3 körningar är möjliga under en arbetsdag.

Quantypers fördelEnligt företaget själva använder de en patenterad SuperConvection™ metod som skall snabba på de olika stegen och därigenom utföra de 40 cyklerna betydligt snabbare. Det talas om upp till 10 gånger så snabbt, men med samma känslighet som dagens q-PCR metoder. På företagets hemsida visas en jämförelse med en, frekvent förekommande q-PCR maskin ABI 7500, där resultatet är tydligt. I vetenskapsvärlden, där det konstant gäller att vara först, är en 10 gångers ökning både kostnadseffektivt och ökar effektiviteten för den egna foskningen. Istället för en analys på 2½ timme så tar det nu 15 min!

Utveckling av PCR-metodenBara under 2009 har PCR-metodiken diskuterats ett flertal gånger i olika "high-impact" tidskrifter, där tankegångarna går åt att man kanske kan sänka antalet cykler från 40 till 30 (Journal of Micromechanics and Microengineering, 19(6):065009, 2009).

Denna debatt är till stor fördel för Quantyper, då den metoden inte bygger på att minska antalet cykler - utan på att snabba upp dem. En minskning från 40 till 30 cykler skulle få oerhört positiva effekter vid användandet av Quantyper, då en analys skulle kunna ta 10 min.

Användande av PCR-metodenqPCR används idag både av forskare på institutioner samt inom sjukvården. Det är en kraftfull metod för att snabbt kunna upptäcka sjukdommar, genetiska förändringar samt effektivitet av behandlingar. Bara inom områden som microbiologi är det en nödvändighet för att snabbt kunna finna botemedel mot sjukdommar som har möjlighet att orsaka globala pandemier, där (svin/fågel)influensa är ett exempel. Jag skulle vilja vara så fräck att hävda; att utan PCR-metodiken skulle många av de sjukdommar vi idag inte ser som farliga vara betydligt farligare. Det är genom en snabb detektion/diagnostik vi bekämpar virus/bakterier idag.

Bolagets finansiella situationKrax skrev 2009-06-18 om bolagets finasiella situation och sedan dess har inget omvälvande skett. Jag citerar några nyckelpunkter från den analysen: "Eftersom Alphahelix nu har färdigutvecklat sin produkt och troligen inte på egen hand kommer fortsätta ev vidareutveckling av den så har man numera slimmat sin organisation med f n endast 3 st anställda." samt "I bolagets senaste rapport redogör man för att de likvida medlen uppgår till 6,3Mkr vilket bör räcka gott och väl för att finansiera driften med nuvarande kostnadsbas ett par år framåt,vilket bör kunna ge bolaget den tid som behövs för att kunna kommersialisera sin produkt."

MarknadÄven här har Krax klargjort att det är en expansiv marknad på en global nivå. Eftersom de flesta som använder PCR-verktyg följer devisen "ju snabbare desto bättre" har jag inga tvivel om att detta verktyg kommer att tas emot väl, av både forskare och anställda inom sjukvärden.

Företaget just nu...För tillfället analyseras Quantyper av ett stort amerikanskt bioteknikföretag och en utvärdering kommer förmodligen inom kort. Detta bolag är även en potentiell sammarbetspartner för att nå en global nivå. Även andra applikationer (Capillette- främst för sjukvården) är under analys av ett italienskt bolag.

SlutsatsFör att dra någon slutsats av analysen måste man förstå vad Quantyper innebär för världen. Jag överdriver inte när jag säger att det är något historiskt som hänt. PCR-tekniken har funnits ända sedan början av 1980-talet, men det är först nu vi ser en utveckling som är värd att satsa på. För mig är detta företag en självklar vinnare.